生物识别技术相对于传统的身份鉴定方法而言，其更具安全、保密和方便性。生物特征识别技术具不易遗忘、防伪性能好、不易伪造或被盗、随身“携带”和随时随地可用等优点。随着人们对安全要求的越来越高、智能技术的越来越成熟，生物识别技术渐渐的融入到门禁控制系统等各个安防领域。智慧技术嵌入生物识别技术，安全双重。

基於非接触式智能卡技术的生物识别读卡器可支援多种认证方式(密码智能卡或密码智能卡指纹)，特别适合安全要求高的金融机构部门(如金库)，从而提高安全性，并符合法规要求。生物识别资料(如指纹模板)并非存储在中央伺服器上，而是持卡人的指纹模板寄存在智能卡内(Match-On-Card)。进入门禁点时，持卡人须于读卡器拍卡及对指纹，持卡人的指纹须与智能卡内指纹模板吻合，才能开门。将指纹模板寄存在智能卡内，可避免黑客入侵系统，从而取得生物识别资料，提供更强大安防水平。

过去十年，市民对国家安防的日益关注，促使世界各地的政府不断完善现有安防政策，提高整体公共安防水平。目前生物识别技术已应用在入境检查，帮助政府监控边境出入，辨别出入境人员的身份。这也导致了电子护照的问世，这种护照内置了护照资讯的非接触式积体电路(IC)晶片，能帮助警员通过加密的生物识别资料验证护照持有人的身份。电子护照功提供了增强的安全性，护照持有人的个人资料和生物识别资料(包括照片丶指纹或虹膜)能安全地存储在护照晶片中，并通过安全的非接触式技术访问。此外，其他政府部门亦使用生物识别技术来保障重要资产，用户必须通过证卡出示以及生物指纹进行双重身份验证来核实身份。这样可有效防止失窃及追踪使用者，维持社会秩序。

现时，有部分企业使用生物识别读卡器用作考勤用途，识别持卡人身份，并纪录出勤纪录，生成报表。印度牙科理事会去年已在全国超过290间牙科学院采用了生物识别读卡器和门禁控制器，识别员工身份，并统一记录全体教员的考勤，从而节省50%的运营成本，并减少人为失误。印度牙科学院经常发生缺勤教职员虚报有值班，影响薪酬计算。生物识别解决方案使标准化中央识别系统使用指纹验证持卡人身份，防止虚报考勤记录，减少薪酬计算错误，实时监控之余，亦避免了记录被篡改。